154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0353 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  99.55 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  40.43 
 
 
245 aa  181  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  35.43 
 
 
239 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  38 
 
 
223 aa  148  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  36.05 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  37.09 
 
 
240 aa  142  4e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  39 
 
 
226 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  39.32 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  36.97 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  40.91 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  40 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1483  sugar fermentation stimulation protein A  37.5 
 
 
215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0977569  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  39.29 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  37.62 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  37.14 
 
 
230 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  40.19 
 
 
229 aa  123  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  34.08 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  36.14 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  37.37 
 
 
230 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  32.3 
 
 
240 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  38.35 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  32.7 
 
 
239 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  34.88 
 
 
232 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  31.48 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1818  sugar fermentation stimulation protein A  33.65 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.195776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  31.48 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  30.8 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  31.48 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  33.17 
 
 
233 aa  99  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  30.9 
 
 
235 aa  98.6  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  34.11 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  28.5 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  31.02 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0164  sugar fermentation stimulation protein  31.98 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  31.02 
 
 
234 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  30.23 
 
 
234 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24781  sugar fermentation stimulation protein A  30.45 
 
 
259 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  31.36 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  32.13 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  29.77 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  32.13 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  32.71 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  30.43 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1628  sugar fermentation stimulation protein A  30.14 
 
 
258 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  28.84 
 
 
234 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  28.37 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  29.76 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  30.77 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  29.68 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  31.73 
 
 
253 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  32.38 
 
 
233 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  29.91 
 
 
239 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  30.24 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02891  sugar fermentation stimulation protein A  30.37 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03401  sugar fermentation stimulation protein A  29.82 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.853569  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  29.26 
 
 
243 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  29.18 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2246  sugar fermentation stimulation protein  29.52 
 
 
268 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.325184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  28.18 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  30.62 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  28.51 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0248  sugar fermentation stimulation protein A  28.5 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  29.44 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  29.02 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02951  sugar fermentation stimulation protein A  28.64 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203564  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  29.44 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  31.42 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  28.77 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  29.3 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3594  sugar fermentation stimulation protein  31.02 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  28.57 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  27.95 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0203  sugar fermentation stimulation protein  31.75 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  29.44 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  30.14 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  26.73 
 
 
238 aa  82  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  28.21 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  30.56 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  31.48 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  28.21 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0277  sugar fermentation stimulation protein A  28.17 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  29.57 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  29.95 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  29.72 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  29.19 
 
 
236 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02851  sugar fermentation stimulation protein A  27.7 
 
 
246 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.504492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  30.21 
 
 
235 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  25.76 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  27.07 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0375  sugar fermentation stimulation protein  31.07 
 
 
248 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460138  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02841  sugar fermentation stimulation protein A  28.17 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  29.87 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0443  sugar fermentation stimulation protein  31.42 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  26.58 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3792  sugar fermentation stimulation protein A  30.09 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  26.2 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  26.2 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  26.2 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>