154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3594 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3594  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  71.31 
 
 
312 aa  344  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0164  sugar fermentation stimulation protein  69.83 
 
 
251 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2246  sugar fermentation stimulation protein  61.74 
 
 
268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.325184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  53.59 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4077  sugar fermentation stimulation protein  51.9 
 
 
261 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  45.15 
 
 
232 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  46.7 
 
 
232 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  45.15 
 
 
231 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  46.29 
 
 
231 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  45.15 
 
 
231 aa  181  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  44.3 
 
 
231 aa  178  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  43.91 
 
 
230 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  39.47 
 
 
232 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  39.47 
 
 
232 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  36.67 
 
 
242 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  36.67 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  41.51 
 
 
238 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  42.42 
 
 
235 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  42.42 
 
 
235 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  36.94 
 
 
250 aa  148  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  39.56 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  37.45 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  39.13 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  37.95 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  38.84 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  35.15 
 
 
234 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  39.57 
 
 
234 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  38.5 
 
 
236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  39.15 
 
 
238 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  39.15 
 
 
238 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  36.36 
 
 
232 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  40.33 
 
 
243 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  38.98 
 
 
237 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0735  sugar fermentation stimulation protein  39.02 
 
 
245 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  38.56 
 
 
231 aa  141  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  34.21 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  40 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  35.22 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  35.81 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4859  sugar fermentation stimulation protein A  37.05 
 
 
241 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177092  hitchhiker  0.00000212378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  35.37 
 
 
234 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  36.89 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3792  sugar fermentation stimulation protein A  36.1 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  40 
 
 
235 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  35.37 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  38.37 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  37.45 
 
 
238 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  36.16 
 
 
234 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  36.16 
 
 
234 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  36.16 
 
 
234 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  36.68 
 
 
234 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  36.68 
 
 
234 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  36.36 
 
 
239 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  36.68 
 
 
234 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  36.68 
 
 
234 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  36.68 
 
 
234 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  36.68 
 
 
234 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  36.68 
 
 
234 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  35.29 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  36.68 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  38.72 
 
 
237 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  35.89 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2818  sugar fermentation stimulation protein  36.84 
 
 
239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0852328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  36.68 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  38.3 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  36.84 
 
 
260 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  35.15 
 
 
234 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3583  sugar fermentation stimulation protein A  40.95 
 
 
235 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.614042  normal  0.47728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0118  sugar fermentation stimulation protein A  38.24 
 
 
244 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  35.96 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  37.77 
 
 
235 aa  131  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  35.81 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  38.59 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  35.81 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  35.81 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  35.81 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  35.81 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  32.75 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  35.53 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  36.6 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  35.09 
 
 
234 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  35.09 
 
 
239 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  35.37 
 
 
234 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4689  sugar fermentation stimulation protein A  39.41 
 
 
237 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  hitchhiker  0.0000000556866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  39.22 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  40.44 
 
 
235 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3100  sugar fermentation stimulation protein A  38.08 
 
 
237 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3467  sugar fermentation stimulation protein A  34.44 
 
 
293 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24781  sugar fermentation stimulation protein A  37.25 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3337  sugar fermentation stimulation protein A  34.02 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000175284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1003  sugar fermentation stimulation protein A  33.74 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000727999  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0248  sugar fermentation stimulation protein A  39.45 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  34.19 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1253  sugar fermentation stimulation protein  40.59 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  34.08 
 
 
237 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03544  sugar fermentation stimulation protein  32.37 
 
 
238 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00902092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  32.49 
 
 
240 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  30.57 
 
 
230 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02891  sugar fermentation stimulation protein A  36.36 
 
 
256 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>