154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2246 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2246  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 		 268 aa  550  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.325184  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  68.57 
 
 		 312 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0164  sugar fermentation stimulation protein  64.26 
 
 		 251 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3594  sugar fermentation stimulation protein  62.95 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  47.1 
 
 		 240 aa  218  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4077  sugar fermentation stimulation protein  48.77 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  42.8 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  44.86 
 
 		 232 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  44.4 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  45.85 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  41.43 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  41.15 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  41.04 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  36.63 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  37.45 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  37.04 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  37.45 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  37.45 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  36.36 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  37.45 
 
 		 234 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  36.25 
 
 		 234 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  36.63 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  37.86 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  40.08 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  39.42 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  39.42 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  38.43 
 
 		 236 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  37.34 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  37.65 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  39.74 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  37.34 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  36.36 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  34.98 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  38.1 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  36.12 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  38.1 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  37.29 
 
 		 241 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0118  sugar fermentation stimulation protein A  37.8 
 
 		 244 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  35.12 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  35.12 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  35.12 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  35.12 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  35.12 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  35.12 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  35.12 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  36.71 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  35.12 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  38.22 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  36.71 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  36.32 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  34.16 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  37.23 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0735  sugar fermentation stimulation protein  40.3 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  39.42 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  34.03 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  38.26 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  37.14 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3792  sugar fermentation stimulation protein A  37.55 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  37.7 
 
 		 232 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  34.3 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4859  sugar fermentation stimulation protein A  36.44 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177092  hitchhiker  0.00000212378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  33.61 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  36.21 
 
 		 239 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  39.06 
 
 		 235 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1033  sugar fermentation stimulation protein  36.84 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  33.48 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  33.96 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  34.63 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2818  sugar fermentation stimulation protein  35.54 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0852328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  33.88 
 
 		 234 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  33.88 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  33.88 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  33.88 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  33.88 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  36.86 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  33.47 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0407  sugar fermentation stimulation protein  36.14 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  39.58 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  37.5 
 
 		 239 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0277  sugar fermentation stimulation protein A  37.83 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0248  sugar fermentation stimulation protein A  37.83 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  35.74 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  34.58 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  37.7 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0443  sugar fermentation stimulation protein  37.11 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  32.16 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24781  sugar fermentation stimulation protein A  36.96 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3467  sugar fermentation stimulation protein A  33.47 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0375  sugar fermentation stimulation protein  35.34 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0707  sugar fermentation stimulation protein  38.27 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0456772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  33.62 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3337  sugar fermentation stimulation protein A  33.2 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000175284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  36.29 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  33.75 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  36.29 
 
 		 237 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1003  sugar fermentation stimulation protein A  33.06 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000727999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1628  sugar fermentation stimulation protein A  35.06 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3100  sugar fermentation stimulation protein A  37.45 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  37.05 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03401  sugar fermentation stimulation protein A  34.2 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.853569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>