154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0277 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0277  sugar fermentation stimulation protein A  100 
 
 
249 aa  512  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0248  sugar fermentation stimulation protein A  84.52 
 
 
254 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24781  sugar fermentation stimulation protein A  73.68 
 
 
259 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02891  sugar fermentation stimulation protein A  66.4 
 
 
256 aa  352  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1628  sugar fermentation stimulation protein A  64.34 
 
 
258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03401  sugar fermentation stimulation protein A  65.02 
 
 
253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.853569  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02951  sugar fermentation stimulation protein A  60.33 
 
 
249 aa  334  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203564  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02841  sugar fermentation stimulation protein A  57.85 
 
 
246 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0264  sugar fermentation stimulation protein A  57.44 
 
 
246 aa  308  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02851  sugar fermentation stimulation protein A  58.26 
 
 
246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.504492  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4859  sugar fermentation stimulation protein A  51.45 
 
 
241 aa  249  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177092  hitchhiker  0.00000212378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  53.59 
 
 
250 aa  246  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  51.65 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  52.89 
 
 
236 aa  238  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  50 
 
 
243 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  49.79 
 
 
239 aa  234  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  49.78 
 
 
242 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  49.78 
 
 
242 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  53.42 
 
 
232 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  52.75 
 
 
231 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  50.45 
 
 
230 aa  189  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  50.46 
 
 
232 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  49.78 
 
 
231 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  49.09 
 
 
243 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  48.47 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  48.86 
 
 
231 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  49.32 
 
 
231 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  48.17 
 
 
237 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  41.36 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  42.86 
 
 
238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  47.25 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  44.04 
 
 
234 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  42.06 
 
 
235 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  42.6 
 
 
234 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  42.6 
 
 
234 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  42.15 
 
 
234 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  43.22 
 
 
237 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  42.6 
 
 
234 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  43.05 
 
 
234 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  40.16 
 
 
239 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  41.88 
 
 
228 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  46.76 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  43.11 
 
 
237 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  41.7 
 
 
234 aa  154  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3337  sugar fermentation stimulation protein A  42.67 
 
 
251 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3984  sugar fermentation stimulation protein  42.66 
 
 
235 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3467  sugar fermentation stimulation protein A  42.67 
 
 
293 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  41.67 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  41.26 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  40.98 
 
 
234 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  40.98 
 
 
234 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03445  sugar fermentation stimulation protein A  41.38 
 
 
238 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  40.98 
 
 
234 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  40.98 
 
 
234 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  40.98 
 
 
234 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  39.68 
 
 
239 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1003  sugar fermentation stimulation protein A  42.24 
 
 
286 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000727999  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  40.98 
 
 
234 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  40.98 
 
 
234 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  40.57 
 
 
234 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  41.56 
 
 
235 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002566  sugar/maltose fermentation stimulation protein  40.98 
 
 
238 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0350154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  38.28 
 
 
256 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  40.62 
 
 
233 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  38.68 
 
 
234 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  40.33 
 
 
235 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  43.84 
 
 
231 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  39.01 
 
 
234 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  41.85 
 
 
238 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  40.36 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  40.81 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  40.97 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  42.08 
 
 
234 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  40.36 
 
 
234 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  44.14 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  41.99 
 
 
237 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  38.02 
 
 
234 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  39 
 
 
232 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  40.37 
 
 
234 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  40.37 
 
 
234 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  40.37 
 
 
234 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  40.37 
 
 
234 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  40.37 
 
 
234 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03544  sugar fermentation stimulation protein  38.12 
 
 
238 aa  141  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00902092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3792  sugar fermentation stimulation protein A  40.89 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  40.25 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  38.84 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  37.83 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  38.84 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3583  sugar fermentation stimulation protein A  38.96 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.614042  normal  0.47728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  40.25 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  40.91 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  42.4 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0164  sugar fermentation stimulation protein  38.74 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2818  sugar fermentation stimulation protein  39.04 
 
 
239 aa  138  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0852328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0735  sugar fermentation stimulation protein  41.33 
 
 
245 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  39.01 
 
 
238 aa  137  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4689  sugar fermentation stimulation protein A  41.2 
 
 
237 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  hitchhiker  0.0000000556866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  39.17 
 
 
237 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  39.91 
 
 
232 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>