154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0731 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  99.15 
 
 		 234 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  95.3 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  92.74 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  86.32 
 
 		 234 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  86.32 
 
 		 234 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  86.32 
 
 		 234 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  85.9 
 
 		 234 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  83.33 
 
 		 234 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  72.65 
 
 		 234 aa  361  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  69.92 
 
 		 238 aa  352  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  68.97 
 
 		 234 aa  344  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  67.95 
 
 		 234 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  65.27 
 
 		 239 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  60.94 
 
 		 256 aa  329  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  63.64 
 
 		 237 aa  305  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  61.9 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  57.76 
 
 		 234 aa  281  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03445  sugar fermentation stimulation protein A  58.26 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  56.9 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1033  sugar fermentation stimulation protein  58.44 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  56.9 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  56.9 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  56.9 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  56.9 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  56.9 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  56.9 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  56.47 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002566  sugar/maltose fermentation stimulation protein  58.26 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0350154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  56.47 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  57.69 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  60.45 
 
 		 233 aa  269  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3984  sugar fermentation stimulation protein  55.13 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  54.74 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  54.74 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  54.74 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  54.74 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3467  sugar fermentation stimulation protein A  54.74 
 
 		 293 aa  265  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  54.74 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3337  sugar fermentation stimulation protein A  54.74 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000175284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2818  sugar fermentation stimulation protein  56.71 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0852328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1003  sugar fermentation stimulation protein A  54.31 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000727999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  54.74 
 
 		 234 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  53.88 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  55.61 
 
 		 237 aa  257  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  56.14 
 
 		 231 aa  255  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  53.02 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  53.85 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  53.42 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  53.85 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  53.67 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2604  sugar fermentation stimulation protein A  52.34 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  53.74 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  51.77 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  52.19 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  50.63 
 
 		 243 aa  238  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  53.48 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  53.98 
 
 		 237 aa  235  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  52.54 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  52.54 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  52.34 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  50.43 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3583  sugar fermentation stimulation protein A  51.71 
 
 		 235 aa  231  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.614042  normal  0.47728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  51.29 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  51.74 
 
 		 235 aa  231  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  51.29 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4689  sugar fermentation stimulation protein A  52.56 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  hitchhiker  0.0000000556866 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  52.61 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0743  sugar fermentation stimulation protein A  52.56 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439553  hitchhiker  0.000000000901638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  51.93 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03544  sugar fermentation stimulation protein  50.42 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00902092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  50.63 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  48.51 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  48.91 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  48.91 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  48.07 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  47.37 
 
 		 232 aa  208  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  48.93 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0735  sugar fermentation stimulation protein  50 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3792  sugar fermentation stimulation protein A  47.56 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  46.79 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1253  sugar fermentation stimulation protein  46.81 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  44.64 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  46.9 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  44.64 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  46.12 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  45.54 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  43.35 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  42.55 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  44.44 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1441  sugar fermentation stimulation protein  47.23 
 
 		 238 aa  187  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393355  normal  0.132407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  45.13 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3100  sugar fermentation stimulation protein A  42.37 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  41.96 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  41.96 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0118  sugar fermentation stimulation protein A  40.6 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  41.96 
 
 		 242 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  41.6 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  42.22 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  43.1 
 
 		 241 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>