154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1033 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1033  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 
239 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2818  sugar fermentation stimulation protein  76.99 
 
 
239 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0852328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  71.98 
 
 
234 aa  358  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  71.12 
 
 
234 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3467  sugar fermentation stimulation protein A  66.81 
 
 
293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3337  sugar fermentation stimulation protein A  66.81 
 
 
251 aa  335  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000175284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1003  sugar fermentation stimulation protein A  66.38 
 
 
286 aa  335  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000727999  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3984  sugar fermentation stimulation protein  68.1 
 
 
235 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  65.8 
 
 
234 aa  323  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  65.8 
 
 
234 aa  323  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  65.8 
 
 
234 aa  323  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  65.8 
 
 
234 aa  323  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  65.8 
 
 
234 aa  323  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  65.8 
 
 
234 aa  323  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  65.8 
 
 
234 aa  323  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  65.8 
 
 
234 aa  323  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  65.37 
 
 
234 aa  322  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  65.09 
 
 
234 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  65.09 
 
 
234 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  65.09 
 
 
234 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  65.09 
 
 
234 aa  318  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  65.09 
 
 
234 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  65.8 
 
 
234 aa  315  5e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002566  sugar/maltose fermentation stimulation protein  60.08 
 
 
238 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0350154  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  59.92 
 
 
256 aa  301  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03445  sugar fermentation stimulation protein A  59.24 
 
 
238 aa  299  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  58.44 
 
 
234 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  58.37 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2604  sugar fermentation stimulation protein A  55.98 
 
 
235 aa  281  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  58.87 
 
 
234 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  58.82 
 
 
234 aa  278  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  61.03 
 
 
228 aa  278  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  58.87 
 
 
237 aa  277  9e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  58.44 
 
 
234 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  59.11 
 
 
238 aa  275  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  57.02 
 
 
234 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  55.6 
 
 
234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  55.84 
 
 
234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  56.28 
 
 
234 aa  268  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  57.14 
 
 
234 aa  268  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  56.58 
 
 
234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  56.58 
 
 
234 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  56.03 
 
 
237 aa  266  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  56.58 
 
 
234 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  50.59 
 
 
256 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  53.39 
 
 
239 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  56.74 
 
 
238 aa  254  8e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  49.79 
 
 
237 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  49.79 
 
 
237 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  51.5 
 
 
235 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  52.94 
 
 
243 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  51.97 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  50.22 
 
 
233 aa  224  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3583  sugar fermentation stimulation protein A  50 
 
 
235 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.614042  normal  0.47728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  50.64 
 
 
237 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  49.79 
 
 
237 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  51.07 
 
 
235 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  48.72 
 
 
237 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  48.93 
 
 
232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  50.44 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  49.12 
 
 
230 aa  218  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0743  sugar fermentation stimulation protein A  49.79 
 
 
237 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439553  hitchhiker  0.000000000901638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4689  sugar fermentation stimulation protein A  48.93 
 
 
237 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  hitchhiker  0.0000000556866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  49.14 
 
 
237 aa  214  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  49.56 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  49.12 
 
 
232 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03544  sugar fermentation stimulation protein  46.61 
 
 
238 aa  209  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00902092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  48.71 
 
 
231 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  48.28 
 
 
231 aa  205  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  44.44 
 
 
241 aa  201  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  45.69 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  46.75 
 
 
235 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  45.45 
 
 
232 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  45.45 
 
 
232 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  46.05 
 
 
232 aa  193  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  43.53 
 
 
238 aa  188  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  44.26 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1253  sugar fermentation stimulation protein  47.06 
 
 
241 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184198  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0118  sugar fermentation stimulation protein A  40.83 
 
 
244 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  43.69 
 
 
235 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  44.35 
 
 
235 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3100  sugar fermentation stimulation protein A  41.6 
 
 
237 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  44.21 
 
 
232 aa  174  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3792  sugar fermentation stimulation protein A  40.89 
 
 
237 aa  171  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0735  sugar fermentation stimulation protein  43.1 
 
 
245 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  42.01 
 
 
250 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1441  sugar fermentation stimulation protein  44.49 
 
 
238 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.393355  normal  0.132407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  40.77 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  40.54 
 
 
239 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  41.59 
 
 
233 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  39.91 
 
 
242 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  38.08 
 
 
239 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0407  sugar fermentation stimulation protein  39.83 
 
 
248 aa  165  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0707  sugar fermentation stimulation protein  40.85 
 
 
237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0456772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  39.91 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  39.41 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  39.41 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  40.42 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  43.1 
 
 
231 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  39.91 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>