154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1457 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  100 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  66.07 
 
 		 235 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  65.49 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  65.49 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  63.72 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  62.56 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  50 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  51.27 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  49.32 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0118  sugar fermentation stimulation protein A  53.3 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3100  sugar fermentation stimulation protein A  50.89 
 
 		 237 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  47.7 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  47.7 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  48.05 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3792  sugar fermentation stimulation protein A  44.84 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0735  sugar fermentation stimulation protein  45.16 
 
 		 245 aa  208  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  47.64 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  46.22 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  46.22 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  47.75 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  46.25 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  44.89 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  45.78 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  46.9 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  45.33 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  44.44 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  44.44 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  44.21 
 
 		 235 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  44.73 
 
 		 238 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  44.1 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  44.59 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  45.05 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  44.1 
 
 		 239 aa  187  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  47.71 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  47.96 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  43.56 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  43.95 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0375  sugar fermentation stimulation protein  43.4 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.460138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0407  sugar fermentation stimulation protein  42.98 
 
 		 248 aa  184  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  41.39 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  46.05 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0707  sugar fermentation stimulation protein  45.98 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0456772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  41.28 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0443  sugar fermentation stimulation protein  43.22 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  43.11 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  41.08 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  41.08 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  41.08 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  42.2 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  42.2 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  39.17 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  42.08 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  39.82 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  41.45 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  41.85 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  42.01 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  41.95 
 
 		 239 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1033  sugar fermentation stimulation protein  38.08 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  41.74 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7664  sugar fermentation stimulation protein  41.74 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  38.84 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03445  sugar fermentation stimulation protein A  41.67 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  41 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3467  sugar fermentation stimulation protein A  38.08 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002566  sugar/maltose fermentation stimulation protein  41.96 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0350154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3337  sugar fermentation stimulation protein A  38.49 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000175284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1003  sugar fermentation stimulation protein A  37.97 
 
 		 286 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000727999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  38.86 
 
 		 256 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  39.91 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  40.91 
 
 		 241 aa  158  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  39.91 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  38.11 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  42.4 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  42.04 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4859  sugar fermentation stimulation protein A  38.74 
 
 		 241 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177092  hitchhiker  0.00000212378 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  39.91 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  38.68 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2818  sugar fermentation stimulation protein  40.09 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0852328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  39.38 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  37.93 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  40.36 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1253  sugar fermentation stimulation protein  43.05 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  40.27 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  37.72 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  40.53 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  39.64 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  40.09 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  38.84 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3984  sugar fermentation stimulation protein  35.59 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  38.84 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>