154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0159 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  65.35 
 
 		 231 aa  320  8e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  66.96 
 
 		 233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  69.3 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  54.63 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  41.96 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  38.29 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  38.71 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  39.23 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  37.85 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  37.99 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  32.72 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  36.94 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  34.29 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  36.24 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  36.94 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  35.91 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  39.05 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  40.19 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  40.19 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  36.87 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  38.57 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  38.33 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0268  sugar fermentation stimulation protein  37.91 
 
 		 362 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0681237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  35.55 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  35.56 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  35.09 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  34.91 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  34.91 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  35.09 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1483  sugar fermentation stimulation protein A  39.39 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0977569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  35.09 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  35.09 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  35.09 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  35.09 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  35.22 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  35.65 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  37.02 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  34.96 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  31.9 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  31.9 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  36.02 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1818  sugar fermentation stimulation protein A  35.58 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.195776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  31.9 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  31.9 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  34.21 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  32.62 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002566  sugar/maltose fermentation stimulation protein  32.33 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0350154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  33.48 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  31.58 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  33.48 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  33.48 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  32.13 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  29.51 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03445  sugar fermentation stimulation protein A  31.98 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  32.19 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1003  sugar fermentation stimulation protein A  29.33 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000727999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  31.76 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3467  sugar fermentation stimulation protein A  28.89 
 
 		 293 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3337  sugar fermentation stimulation protein A  28.89 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000175284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  35.65 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  33.62 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  32.14 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  30.8 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  31.08 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  29.86 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  29.86 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  29.2 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  29.92 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  29.92 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  29.86 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  33.04 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  34.48 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  33.47 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  29.92 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0203  sugar fermentation stimulation protein  30.73 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  33.77 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  29.86 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  29.41 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  32 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  32.89 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  33.48 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  36.14 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4077  sugar fermentation stimulation protein  32.74 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  32.17 
 
 		 240 aa  92  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3984  sugar fermentation stimulation protein  30.18 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  34.78 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  32.61 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  34.47 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  29.82 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  34.08 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  30.84 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  31.88 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  29.69 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1033  sugar fermentation stimulation protein  32.02 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3100  sugar fermentation stimulation protein A  33.61 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  32.17 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  30.87 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  30.26 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  32.03 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>