154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3473 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  59.29 
 
 
228 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  46.78 
 
 
230 aa  188  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  46.35 
 
 
230 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  44.34 
 
 
230 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  43.11 
 
 
226 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  42.57 
 
 
240 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  42.93 
 
 
233 aa  168  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  41.74 
 
 
234 aa  164  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  38.91 
 
 
239 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  37.81 
 
 
233 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  34.96 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  37.5 
 
 
231 aa  144  9e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  36.84 
 
 
230 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  35.71 
 
 
223 aa  142  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  39.37 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  39 
 
 
222 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  39 
 
 
222 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  36.27 
 
 
239 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  33.33 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  35.44 
 
 
247 aa  131  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  34.67 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  32.72 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  35 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  32.89 
 
 
232 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  36.27 
 
 
240 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  31.84 
 
 
232 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  33.62 
 
 
234 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  33.94 
 
 
231 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  33.62 
 
 
234 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  30.45 
 
 
232 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  32.31 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  33.77 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0203  sugar fermentation stimulation protein  30.13 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  32.75 
 
 
234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03544  sugar fermentation stimulation protein  34.73 
 
 
238 aa  118  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00902092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  32.31 
 
 
234 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  32.31 
 
 
234 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  32.43 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  31.88 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  31.58 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  31.88 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  30.84 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  31.28 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  31.42 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  30.77 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  29 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  30.49 
 
 
231 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  29.26 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  30.13 
 
 
234 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  32.3 
 
 
234 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  30.43 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  30.13 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  32.27 
 
 
250 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1628  sugar fermentation stimulation protein A  31.98 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  30 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  30.43 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  29.79 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  29.6 
 
 
231 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1818  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 
234 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.195776  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1483  sugar fermentation stimulation protein A  34.02 
 
 
215 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0977569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  29.26 
 
 
235 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  32.21 
 
 
234 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4077  sugar fermentation stimulation protein  28.9 
 
 
261 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0305359 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  31.88 
 
 
234 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  31.88 
 
 
234 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  29.73 
 
 
237 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  31.88 
 
 
234 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  31.88 
 
 
234 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  31.88 
 
 
234 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  31.88 
 
 
234 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0248  sugar fermentation stimulation protein A  29.73 
 
 
254 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  30.57 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  32.06 
 
 
236 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  30.57 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  30.47 
 
 
235 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  31.63 
 
 
242 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  30.57 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  30.57 
 
 
234 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03401  sugar fermentation stimulation protein A  32.14 
 
 
253 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.853569  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  30.19 
 
 
238 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  29.85 
 
 
240 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4689  sugar fermentation stimulation protein A  30.6 
 
 
237 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714813  hitchhiker  0.0000000556866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  31.44 
 
 
234 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  29.02 
 
 
312 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  31.44 
 
 
234 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  31.44 
 
 
234 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  31.92 
 
 
242 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  30.57 
 
 
234 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  29.36 
 
 
238 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  30.13 
 
 
237 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0268  sugar fermentation stimulation protein  30.2 
 
 
362 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0681237  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02891  sugar fermentation stimulation protein A  28.38 
 
 
256 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  32.11 
 
 
238 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  28.37 
 
 
253 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  27.39 
 
 
239 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3583  sugar fermentation stimulation protein A  29.07 
 
 
235 aa  99  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.614042  normal  0.47728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  31.34 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0735  sugar fermentation stimulation protein  28.64 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>