154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0560 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  100 
 
 
230 aa  460  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  98.7 
 
 
230 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  54.55 
 
 
230 aa  231  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  49.57 
 
 
228 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  46.02 
 
 
226 aa  198  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  46.78 
 
 
226 aa  188  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  44.55 
 
 
233 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  36.73 
 
 
232 aa  157  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  36.92 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  33.62 
 
 
248 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  35.32 
 
 
234 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  35.74 
 
 
234 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  39.62 
 
 
240 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  35.65 
 
 
232 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  35.65 
 
 
232 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  35.32 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  34.05 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  35.02 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  35.02 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  34.47 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  33.19 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  33.33 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  34.96 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  34.96 
 
 
234 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  34.96 
 
 
234 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  32.9 
 
 
232 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  33.19 
 
 
234 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  34.05 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  34.67 
 
 
232 aa  134  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03544  sugar fermentation stimulation protein  34.3 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00902092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  35.56 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  34.82 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  33.33 
 
 
237 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  34.76 
 
 
232 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  31.53 
 
 
240 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  35.14 
 
 
231 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 
234 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  39.3 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  35.65 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  32.34 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  33.33 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  38.76 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  34.84 
 
 
231 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  32.91 
 
 
234 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  33.19 
 
 
231 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  35.29 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  33.33 
 
 
232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  35.43 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  39.5 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  33.76 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  34.8 
 
 
237 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  37.62 
 
 
222 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  31.62 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  31.62 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  31.62 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  31.62 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  37.62 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  32.6 
 
 
237 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  30.3 
 
 
239 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  32.16 
 
 
237 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0203  sugar fermentation stimulation protein  33.78 
 
 
218 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  31.62 
 
 
234 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1033  sugar fermentation stimulation protein  32.03 
 
 
239 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  35.41 
 
 
234 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  36.41 
 
 
247 aa  121  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  39.05 
 
 
229 aa  121  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  30.13 
 
 
256 aa  121  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3583  sugar fermentation stimulation protein A  30.93 
 
 
235 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.614042  normal  0.47728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  31.25 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  33.18 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  36.79 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  37.33 
 
 
221 aa  119  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  32.77 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  40.59 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  33.03 
 
 
231 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  35.32 
 
 
233 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  29.49 
 
 
234 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  32.88 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  32.88 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  32.26 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  32.39 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  32.88 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03445  sugar fermentation stimulation protein A  31.09 
 
 
238 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  36.63 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  38.43 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0164  sugar fermentation stimulation protein  28.63 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  34.45 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  30.49 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  29.6 
 
 
312 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  32.07 
 
 
237 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3594  sugar fermentation stimulation protein  29.03 
 
 
247 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  31.62 
 
 
241 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0743  sugar fermentation stimulation protein A  32.91 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439553  hitchhiker  0.000000000901638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>