154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2973 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  48.39 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  44.55 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  43.64 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  43.56 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  42.13 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  42.93 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  43.32 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  42.51 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  42.67 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  37.27 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  37.28 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  35.74 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  37.27 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03544  sugar fermentation stimulation protein  34.44 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00902092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  35.9 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  35.47 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  35.47 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  34.91 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  35.47 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  36.12 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  40.17 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  34.47 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  35.85 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  34.89 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  37.02 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  33.76 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  36.09 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  34.47 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  34.47 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  35.48 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  35.41 
 
 		 240 aa  128  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  39.41 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  35.68 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  32.51 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  33.9 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  34.26 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  39.9 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  37.88 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  37.73 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  32.49 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  34.6 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  32.49 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  35.17 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  35.17 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0203  sugar fermentation stimulation protein  35.24 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  32.62 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  36.41 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  33.64 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  33.48 
 
 		 234 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  36.77 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  34.36 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  34.03 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  34.03 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  34.45 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  34.22 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  34.31 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  34.26 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  34.22 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  34.22 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  35.16 
 
 		 237 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  38.33 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  32.33 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  32.89 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  34.1 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  33.19 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1045  sugar fermentation stimulation protein  30.09 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0926  sugar fermentation stimulation protein  30.09 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  32.73 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1033  sugar fermentation stimulation protein  32.41 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  33.81 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  34.38 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  36.16 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  33.19 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  33.8 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0268  sugar fermentation stimulation protein  34.39 
 
 		 362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0681237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3594  sugar fermentation stimulation protein  30.52 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  31.98 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  32.33 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  36.36 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0164  sugar fermentation stimulation protein  31.28 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0118  sugar fermentation stimulation protein A  34.23 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  34.23 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  33.33 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  29.96 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  29.96 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  29.96 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  29.96 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  33.18 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  29.96 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2604  sugar fermentation stimulation protein A  31.09 
 
 		 235 aa  105  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  32.91 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0735  sugar fermentation stimulation protein  30.61 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>