153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1005 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  71.05 
 
 		 231 aa  342  2e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  68.86 
 
 		 233 aa  323  2e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  69.3 
 
 		 229 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  54.63 
 
 		 230 aa  246  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  40.09 
 
 		 240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  38.53 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  41.95 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  35.48 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  37.39 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  38.46 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  38.46 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  33.49 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  38.16 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  35.53 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  35 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  35.91 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  36.55 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  38.35 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  38.35 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0268  sugar fermentation stimulation protein  39.34 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0681237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  32.31 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  34.53 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  35.96 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  35.47 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  31.46 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  36.36 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  35.68 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  32 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1818  sugar fermentation stimulation protein A  35.86 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.195776  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  31 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1483  sugar fermentation stimulation protein A  37.02 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0977569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  36.17 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  31.3 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  31.3 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  31.3 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  30.28 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  31.3 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  31.3 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  31.3 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  31.7 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  31.7 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  32.05 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  32.05 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  30.87 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  30.49 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1911  sugar fermentation stimulation protein A  31 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  30.43 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  31.11 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  32.74 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  30.84 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  29.91 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  29.91 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  30 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  30.99 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  27.8 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  29.91 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  30.53 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  32.63 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1003  sugar fermentation stimulation protein A  29.46 
 
 		 286 aa  92  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000727999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  32.03 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  33.04 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3337  sugar fermentation stimulation protein A  29.46 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000175284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3467  sugar fermentation stimulation protein A  29.46 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.52495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3938  sugar fermentation stimulation protein  29.65 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000378035  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  34.09 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  29.15 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  28.25 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  32.77 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002566  sugar/maltose fermentation stimulation protein  28.57 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0350154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  33.49 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  33.98 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2275  sugar fermentation stimulation protein  30.6 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0278821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  31.3 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3792  sugar fermentation stimulation protein A  31.17 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144138  unclonable  0.000000169816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  31.3 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  28.7 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  31.33 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  33.94 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  32.22 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2468  sugar fermentation stimulation protein A  33.18 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.0256985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0128  sugar fermentation stimulation protein A  28.63 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0147515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03445  sugar fermentation stimulation protein A  28.12 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  30.65 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0203  sugar fermentation stimulation protein  31.15 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  32.09 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  32.86 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  29.6 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  31.38 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  26.14 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  29.55 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0118  sugar fermentation stimulation protein A  32.74 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  25.31 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  31.47 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>