153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1818 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1818  sugar fermentation stimulation protein A  100 
 
 
234 aa  470  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.195776  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  37.56 
 
 
231 aa  112  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  37.5 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  30.23 
 
 
245 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0268  sugar fermentation stimulation protein  35.24 
 
 
362 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0681237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  36.36 
 
 
221 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  34.26 
 
 
230 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  32.49 
 
 
226 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  32.55 
 
 
232 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  34.16 
 
 
230 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  31.14 
 
 
233 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  35.86 
 
 
232 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  30.59 
 
 
239 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  35.58 
 
 
229 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  33.65 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  33.65 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  29.72 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  34.62 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  33.33 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  28.86 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  29.67 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  28.5 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  32.87 
 
 
230 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  31.75 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  28.38 
 
 
247 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  29.96 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  28.87 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  31.25 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  28.88 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  31.28 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  28.96 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  32.08 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  29.06 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0164  sugar fermentation stimulation protein  28.44 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  27.59 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  29.06 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  29.34 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  29.06 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  29.06 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  29.06 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  28.3 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  29.06 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  28.3 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  29.06 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  29.06 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  29.06 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  29.06 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  26.64 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  29.74 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  26.64 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  27.83 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7664  sugar fermentation stimulation protein  30.54 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  27.88 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  26.48 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  30.33 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  26.99 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  30.21 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  26.99 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3113  sugar fermentation stimulation protein A  29.13 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0324804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  26.99 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1483  sugar fermentation stimulation protein A  31.12 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0977569  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4140  sugar fermentation stimulation protein  30.96 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000339491  hitchhiker  0.00000947467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  28.96 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  30 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  26.99 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  30.9 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  30.39 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0686  sugar fermentation stimulation protein A  27.35 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000908264  normal  0.5935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  30.84 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  28.57 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  30.09 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1165  sugar fermentation stimulation protein A  28.64 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  27.83 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0284  sugar fermentation stimulation protein A  34.67 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  30.73 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3059  sugar fermentation stimulation protein  31.84 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.18216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  26.55 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4077  sugar fermentation stimulation protein  30.58 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  30.13 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  28.5 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  31.62 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  26.86 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3984  sugar fermentation stimulation protein  26.54 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1253  sugar fermentation stimulation protein  31.33 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.184198  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  28.86 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  25.83 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0675  sugar fermentation stimulation protein  30.37 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  28.37 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  30.92 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1364  sugar fermentation stimulation protein  28.64 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5437  sugar fermentation stimulation protein A  31.73 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  28.1 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3583  sugar fermentation stimulation protein A  31.56 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.614042  normal  0.47728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  29.74 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  26.22 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3371  sugar fermentation stimulation protein A  29 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679451  normal  0.0292733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  28.1 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0118  sugar fermentation stimulation protein A  28.57 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2246  sugar fermentation stimulation protein  27.19 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.325184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62470  sugar fermentation stimulation protein A  31.6 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>