153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0168 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  45.03 
 
 
223 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  35.43 
 
 
222 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  35.43 
 
 
222 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  39.91 
 
 
234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  36.24 
 
 
245 aa  136  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  41.75 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  36.27 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1483  sugar fermentation stimulation protein A  36.36 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0977569  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  38.02 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  35.85 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  35.48 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  35.45 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  34.96 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  35.91 
 
 
229 aa  125  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  34.31 
 
 
228 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  36.46 
 
 
233 aa  122  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  31.8 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  33.02 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  38.43 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  33.33 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  31.19 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  37.5 
 
 
230 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0268  sugar fermentation stimulation protein  29.05 
 
 
362 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0681237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  36.14 
 
 
230 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  34.1 
 
 
221 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1818  sugar fermentation stimulation protein A  30.59 
 
 
234 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.195776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  28.5 
 
 
231 aa  95.1  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  30.09 
 
 
237 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  30.84 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  30.14 
 
 
231 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0264  sugar fermentation stimulation protein A  30.93 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  27.03 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1628  sugar fermentation stimulation protein A  30.91 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  29.68 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  29.55 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  28.11 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  28.64 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  27.72 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  31.94 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  30.23 
 
 
232 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  28.84 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  29.69 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  27.4 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  27.4 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  27.4 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  26.94 
 
 
234 aa  85.1  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  26.17 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  26.67 
 
 
241 aa  85.1  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  26.82 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03401  sugar fermentation stimulation protein A  30.45 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.853569  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  26.94 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4859  sugar fermentation stimulation protein A  28.38 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177092  hitchhiker  0.00000212378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  25.57 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  27.63 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  27.27 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02851  sugar fermentation stimulation protein A  29.49 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.504492  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  26.7 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  28.17 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  27.4 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02841  sugar fermentation stimulation protein A  29.95 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24781  sugar fermentation stimulation protein A  26.94 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  27.14 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  27.39 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  25.91 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  26.94 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0277  sugar fermentation stimulation protein A  26.55 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  26.67 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0203  sugar fermentation stimulation protein  31.35 
 
 
218 aa  82  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  27.96 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1457  sugar fermentation stimulation protein A  27.04 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  27.66 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  26.48 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  27.66 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  27.66 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02951  sugar fermentation stimulation protein A  31.51 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  27.66 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  27.66 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  26.48 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  27.66 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  27.66 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  26.07 
 
 
243 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  26.82 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  26.82 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  26.82 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  26.82 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  27.66 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  27.66 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  28.26 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1456  sugar fermentation stimulation protein A  28.96 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  27.48 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1281  sugar fermentation stimulation protein A  29.36 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00158062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  27.68 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  28.09 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  28.57 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1047  sugar fermentation stimulation protein  28.64 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.216128 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1244  sugar fermentation stimulation protein A  29.36 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0883091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  28.26 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03445  sugar fermentation stimulation protein A  28.05 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3984  sugar fermentation stimulation protein  28.05 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>