152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0826 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0826  sugar fermentation stimulation protein  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000350314  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2325  sugar fermentation stimulation protein  44.69 
 
 
234 aa  191  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0578414  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0168  sugar fermentation stimulation protein  45.03 
 
 
239 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0871  sugar fermentation stimulation protein  39.19 
 
 
245 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000605293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0085  sugar fermentation stimulation protein  34.98 
 
 
247 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.675959  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0381  sugar fermentation stimulation protein  41.95 
 
 
240 aa  151  8e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0371  sugar fermentation stimulation protein  38 
 
 
222 aa  148  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00357575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0353  sugar fermentation stimulation protein  38 
 
 
222 aa  148  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1483  sugar fermentation stimulation protein A  36.61 
 
 
215 aa  143  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0977569  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3473  sugar fermentation stimulation protein A  35.71 
 
 
226 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0650929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1036  sugar fermentation stimulation protein A  35.44 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000583266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0560  sugar fermentation stimulation protein A  39.3 
 
 
230 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06160  sugar fermentation stimulation protein  38 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0574  sugar fermentation stimulation protein A  39.18 
 
 
230 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0768  sugar fermentation stimulation protein  33.65 
 
 
230 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1878  sugar fermentation stimulation protein  35.53 
 
 
231 aa  121  8e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0159  sugar fermentation stimulation protein  36.87 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.998892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2531  sugar fermentation stimulation protein  33.03 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0936585  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1241  sugar fermentation stimulation protein  35.53 
 
 
233 aa  119  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1005  sugar fermentation stimulation protein  35.53 
 
 
232 aa  119  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.383313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2973  sugar fermentation stimulation protein  33.64 
 
 
233 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2335  sugar fermentation stimulation protein  33.65 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0815  sugar fermentation stimulation protein A  32.58 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000392734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0431  sugar fermentation stimulation protein  32.83 
 
 
232 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.386626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0712  sugar fermentation stimulation protein  30.56 
 
 
260 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0430  sugar fermentation stimulation protein  31.36 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4859  sugar fermentation stimulation protein A  30.59 
 
 
241 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00177092  hitchhiker  0.00000212378 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0264  sugar fermentation stimulation protein A  30.21 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3275  sugar fermentation stimulation protein A  30.1 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000414007  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02851  sugar fermentation stimulation protein A  29.24 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.504492  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3891  sugar fermentation stimulation protein  28.05 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2716  sugar fermentation stimulation protein  28.18 
 
 
232 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0699  sugar fermentation stimulation protein A  31.73 
 
 
234 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000947807  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0268  sugar fermentation stimulation protein  26.99 
 
 
362 aa  92  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0681237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1723  sugar fermentation stimulation protein  26.17 
 
 
242 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363148  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3128  sugar fermentation stimulation protein A  29.65 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000110927  normal  0.0371507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3453  sugar fermentation stimulation protein  29.81 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1069  sugar fermentation stimulation protein  30.43 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2312  sugar fermentation stimulation protein  26.48 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.132627  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0781  sugar fermentation stimulation protein A  27.32 
 
 
237 aa  89  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0503514  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2282  sugar fermentation stimulation protein  29.8 
 
 
231 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000647555  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03401  sugar fermentation stimulation protein A  29.26 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.853569  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0277  sugar fermentation stimulation protein A  25.21 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6951  sugar fermentation stimulation protein  24.44 
 
 
239 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2725  sugar fermentation stimulation protein  32.26 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0873  sugar fermentation stimulation protein A  28.99 
 
 
234 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000194296  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02841  sugar fermentation stimulation protein A  27.97 
 
 
246 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3489  sugar fermentation stimulation protein A  28.99 
 
 
234 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000560282  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0850  sugar fermentation stimulation protein A  28.99 
 
 
234 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0137  sugar fermentation stimulation protein A  28.16 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000754375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2040  sugar fermentation stimulation protein A  27.44 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.619365  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3169  sugar fermentation stimulation protein A  28.3 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0711  sugar fermentation stimulation protein  28.77 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.121743  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2466  sugar fermentation stimulation protein  29.35 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000228213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0157  sugar fermentation stimulation protein A  26.43 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00655065  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00145  sugar fermentation stimulation protein A  25.99 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000421798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00144  hypothetical protein  25.99 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000351807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4111  sugar fermentation stimulation protein  26.61 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1121  sugar fermentation stimulation protein  28.14 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3456  sugar fermentation stimulation protein  25.99 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0155  sugar fermentation stimulation protein A  25.99 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0236275  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0149  sugar fermentation stimulation protein A  25.99 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000002037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0150  sugar fermentation stimulation protein A  25.99 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000342468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3513  sugar fermentation stimulation protein A  25.99 
 
 
234 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0325087  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2279  sugar fermentation stimulation protein  29.03 
 
 
235 aa  85.1  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1698  sugar fermentation stimulation protein  25.11 
 
 
242 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2098  sugar fermentation stimulation protein  28.71 
 
 
238 aa  84.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3227  sugar fermentation stimulation protein  24.66 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4305  sugar fermentation stimulation protein  30.66 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1628  sugar fermentation stimulation protein A  27.95 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0885  sugar fermentation stimulation protein A  28.99 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000130256  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1127  sugar fermentation stimulation protein  27.86 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3021  sugar fermentation stimulation protein  26.85 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02891  sugar fermentation stimulation protein A  25.51 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1751  sugar fermentation stimulation protein  29.35 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4691  sugar fermentation stimulation protein A  27.19 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.000197761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4555  sugar fermentation stimulation protein A  27.19 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  hitchhiker  0.000000844744 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02951  sugar fermentation stimulation protein A  25.31 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0731  sugar fermentation stimulation protein A  28.16 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206265  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3403  sugar fermentation stimulation protein A  28.64 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000350533  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3376  sugar fermentation stimulation protein  29.15 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42620  sugar fermentation stimulation protein A  25.44 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1876  sugar fermentation stimulation protein  26.34 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0032893  hitchhiker  0.00621743 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0248  sugar fermentation stimulation protein A  24.68 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0231  sugar fermentation stimulation protein A  27.49 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0837  sugar fermentation stimulation protein A  26.55 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000382941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3797  sugar fermentation stimulation protein A  28.77 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000110503  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3291  sugar fermentation stimulation protein A  27.67 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000125769  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0875  sugar fermentation stimulation protein A  27.18 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2205  sugar fermentation stimulation protein  26.21 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0203  sugar fermentation stimulation protein A  25.73 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0215  sugar fermentation stimulation protein A  25.73 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0219  sugar fermentation stimulation protein A  25.73 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0204  sugar fermentation stimulation protein A  25.73 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3898  sugar fermentation stimulation protein A  26.96 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000015778  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0971  sugar fermentation stimulation protein  25.22 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000643162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3594  sugar fermentation stimulation protein  25.71 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3127  sugar fermentation stimulation protein A  28.02 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000109338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4802  sugar fermentation stimulation protein A  25.22 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  hitchhiker  0.006792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0221  sugar fermentation stimulation protein A  25.73 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>