132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1204 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1204  major facilitator transporter  100 
 
 		 510 aa  1012    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 437 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 436 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 436 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 		 437 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  25.78 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  25.18 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 430 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  24.08 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  23.09 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  22.72 
 
 		 402 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.61 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  26.79 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  22.4 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  22.4 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  25 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  22.2 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  22.14 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  22.14 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  22.14 
 
 		 400 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  22.14 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  23.37 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  22.14 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  22.14 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 407 aa  62  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  22.74 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.82 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  22.56 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  26.61 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.51 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 412 aa  57  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  24.33 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  24.1 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 421 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  24.41 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  26.29 
 
 		 404 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 418 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  24.38 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  23.82 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  23.82 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  23.82 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  23.82 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  23.82 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 380 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  24.59 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  23.82 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  21.14 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 432 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 421 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 431 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 441 aa  50.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  22.04 
 
 		 402 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>