More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1999 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1999  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
471 aa  949    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.594341  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1678  Peptidoglycan glycosyltransferase  61.69 
 
 
456 aa  548  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542688  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0768  peptidoglycan glycosyltransferase  40.81 
 
 
448 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
689 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.74 
 
 
657 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.98 
 
 
703 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 
630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.87 
 
 
577 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
630 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
632 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
632 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 
618 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
632 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
675 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
570 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  34.29 
 
 
657 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  31.06 
 
 
631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  31.26 
 
 
578 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  30.86 
 
 
581 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.34 
 
 
695 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
577 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
582 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  30.66 
 
 
577 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.33 
 
 
645 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3749  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 
607 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425103  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.51 
 
 
614 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 
580 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
614 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
702 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.93 
 
 
582 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 
654 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 
582 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
578 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 
579 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 
578 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 
586 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 
582 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  30 
 
 
595 aa  167  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  30.07 
 
 
582 aa  167  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.05 
 
 
562 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.73 
 
 
656 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
662 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  29.31 
 
 
594 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.41 
 
 
657 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  29.14 
 
 
596 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  29.08 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  29.08 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  28.92 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  29.08 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  29.08 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.26 
 
 
644 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  29.08 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 
582 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.77 
 
 
654 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  32.71 
 
 
594 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 
594 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05821  peptidoglycan synthetase  31.04 
 
 
583 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 
588 aa  163  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  29.55 
 
 
622 aa  163  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.59 
 
 
660 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0076  penicillin-binding protein  31.52 
 
 
465 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 
577 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  29.81 
 
 
577 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 
578 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  31.52 
 
 
570 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  31.52 
 
 
570 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  31.52 
 
 
570 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  31.52 
 
 
570 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  31.92 
 
 
644 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 
581 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  31.29 
 
 
570 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
690 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  31.29 
 
 
615 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  31.41 
 
 
585 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  29.56 
 
 
599 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  31.39 
 
 
646 aa  160  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 
613 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 
613 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1250  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 
592 aa  159  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0497738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
589 aa  159  9e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  31.34 
 
 
578 aa  159  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.62 
 
 
581 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 
590 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  29.52 
 
 
605 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 
594 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 
723 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 
553 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 
657 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4471  peptidoglycan synthetase FtsI  30.8 
 
 
591 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  29.49 
 
 
719 aa  156  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 
556 aa  156  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  30.86 
 
 
597 aa  156  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.9 
 
 
595 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  29.84 
 
 
607 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 
839 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
571 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.9 
 
 
595 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 
587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 
631 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 
580 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>