More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0768 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0768  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
448 aa  912    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1678  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.56 
 
 
456 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542688  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1999  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.81 
 
 
471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.594341  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  38.88 
 
 
653 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.88 
 
 
645 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.34 
 
 
657 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 
657 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.96 
 
 
662 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
654 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  38.61 
 
 
675 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 
727 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  34.64 
 
 
581 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.54 
 
 
644 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  35.97 
 
 
607 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  35.31 
 
 
660 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  35.27 
 
 
657 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.14 
 
 
582 aa  219  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.14 
 
 
582 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 
580 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 
586 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  35.37 
 
 
630 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 
578 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
632 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
632 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
632 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  35.66 
 
 
656 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 
583 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.37 
 
 
577 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 
630 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 
570 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 
582 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  33.99 
 
 
553 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
654 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.12 
 
 
703 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 
657 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  34.4 
 
 
618 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  33.65 
 
 
577 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  33.74 
 
 
553 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 
614 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  35.9 
 
 
577 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
702 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.41 
 
 
583 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  33.98 
 
 
596 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  34.47 
 
 
631 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  33.01 
 
 
594 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  34.28 
 
 
695 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  33.49 
 
 
594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  33.73 
 
 
594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  33.49 
 
 
594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  33.49 
 
 
594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  33.49 
 
 
594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  33.73 
 
 
594 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 
586 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 
690 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.39 
 
 
581 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  33.97 
 
 
587 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
656 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 
710 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 
578 aa  199  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  34.46 
 
 
556 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 
578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.22 
 
 
571 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  34.62 
 
 
577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 
582 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  34.07 
 
 
579 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  33.81 
 
 
597 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 
590 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  33.9 
 
 
601 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  34.38 
 
 
579 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  34.07 
 
 
579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  32.53 
 
 
565 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
638 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  35.92 
 
 
670 aa  196  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  35.7 
 
 
548 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  33.98 
 
 
582 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
613 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  33.73 
 
 
580 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 
613 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  35.7 
 
 
552 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 
655 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  32.09 
 
 
565 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 
610 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  33.9 
 
 
622 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 
578 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 
590 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 
578 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 
594 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  33.92 
 
 
594 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  33.41 
 
 
583 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  33.25 
 
 
581 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
708 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
578 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.74 
 
 
588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 
614 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 
675 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 
631 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
580 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 
839 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.7 
 
 
711 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>