More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0076 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0076  penicillin-binding protein  100 
 
 
465 aa  910    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1082  penicillin-binding protein  100 
 
 
570 aa  907    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.443552  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1750  penicillin-binding protein  99.14 
 
 
570 aa  899    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.25987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0239  penicillin-binding protein  99.35 
 
 
615 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.229072  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0343  penicillin-binding protein  100 
 
 
570 aa  907    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.503077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1661  penicillin-binding protein  99.35 
 
 
570 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1244  penicillin-binding protein  100 
 
 
570 aa  907    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.313852  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  49.57 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  49.57 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  49.57 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  49.57 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  49.57 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  49.57 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  49.57 
 
 
594 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  49.36 
 
 
596 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  48.71 
 
 
618 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  48.71 
 
 
630 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  49.14 
 
 
630 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  48.28 
 
 
632 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  48.28 
 
 
632 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  48.28 
 
 
632 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  48.6 
 
 
577 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.05 
 
 
595 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  47.41 
 
 
631 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  47.94 
 
 
605 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.06 
 
 
577 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  47.62 
 
 
578 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.62 
 
 
595 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  47.4 
 
 
595 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  47.7 
 
 
581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  49.02 
 
 
582 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.65 
 
 
582 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  45.65 
 
 
582 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  47.29 
 
 
600 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  46.29 
 
 
580 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  44.28 
 
 
624 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.42 
 
 
621 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  43.56 
 
 
614 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  43.35 
 
 
614 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  43.35 
 
 
614 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  43.35 
 
 
614 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  43.35 
 
 
614 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  43.35 
 
 
614 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  44.21 
 
 
621 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  43.35 
 
 
614 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  44.76 
 
 
607 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  43.35 
 
 
614 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  42.39 
 
 
582 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  46.41 
 
 
583 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  43.67 
 
 
577 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 
582 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  43.89 
 
 
614 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  43.01 
 
 
578 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  44.09 
 
 
615 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.45 
 
 
588 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  44.09 
 
 
615 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  44.3 
 
 
616 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  43.66 
 
 
615 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  44.09 
 
 
615 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  43.66 
 
 
615 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  43.66 
 
 
615 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0175  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.94 
 
 
590 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  45.34 
 
 
577 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  42.33 
 
 
580 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  43.07 
 
 
590 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  43.37 
 
 
587 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.69 
 
 
570 aa  349  8e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  41.81 
 
 
552 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  41.81 
 
 
548 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  41.38 
 
 
570 aa  340  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  39 
 
 
553 aa  336  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  38.78 
 
 
553 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  42.08 
 
 
601 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  41.47 
 
 
597 aa  332  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 
586 aa  328  9e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  39.04 
 
 
577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  40.09 
 
 
565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.87 
 
 
571 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  38.74 
 
 
587 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  41.18 
 
 
622 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  39.77 
 
 
565 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  39.48 
 
 
576 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  39.43 
 
 
583 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  39.52 
 
 
568 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  40.18 
 
 
575 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.52 
 
 
614 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  39.41 
 
 
578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  39.96 
 
 
575 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  40.31 
 
 
613 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  40.14 
 
 
579 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  40 
 
 
570 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  40.14 
 
 
579 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  40.09 
 
 
613 aa  319  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  39.7 
 
 
580 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  39.82 
 
 
579 aa  317  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  37.01 
 
 
585 aa  316  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  39.58 
 
 
580 aa  316  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  39.11 
 
 
582 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  38.89 
 
 
582 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  37.47 
 
 
583 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>