135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5440 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010727  Mpop_5440  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
321 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  46.84 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0614  glycosyltransferase  48.3 
 
 
325 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0565  glycosyl transferase group 1  46.65 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2208  glycosyl transferase, group 1  46.82 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0393542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1739  glycosyl transferase group 1  46.37 
 
 
317 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1666  glycosyl transferase group 1  46.06 
 
 
317 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1755  glycosyl transferase, group 1  41.05 
 
 
327 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.66004  normal  0.478923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1614  glycosyl transferase, group 1  38.77 
 
 
330 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2053  glycosyl transferase group 1  40.07 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1726  glycosyl transferase group 1  42.99 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
343 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
367 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
395 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 
406 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
364 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
1080 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
370 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
374 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
419 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
398 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
419 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
350 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
409 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
394 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
385 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  31.13 
 
 
419 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
387 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 
770 aa  49.3  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  26.7 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
375 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  30.9 
 
 
378 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  27.12 
 
 
368 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
375 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  31.07 
 
 
378 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  28.83 
 
 
430 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
387 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
395 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  28.81 
 
 
376 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  27.14 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
660 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
346 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
639 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  26.59 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
419 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
413 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
389 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
415 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  41.76 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
398 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.1 
 
 
370 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
386 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0583  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
428 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
387 aa  46.2  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
395 aa  45.8  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
421 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1763  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 
402 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.656807  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  22.56 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
401 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  41.56 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 
462 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  20.51 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1440  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
414 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.185476  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0559  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  29.88 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1422  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  46.03 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.9 
 
 
396 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  25.79 
 
 
366 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>