More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1440 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1440  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
414 aa  816    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.185476  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1763  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
402 aa  792    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.656807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
377 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
368 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 
366 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
821 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.38 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
369 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.39 
 
 
468 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.79 
 
 
371 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
821 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
386 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
359 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
390 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
396 aa  86.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
819 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
389 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
828 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
822 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.56 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.56 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.56 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  35.56 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  35.56 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  35.56 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.56 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
821 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
345 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.89 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 
821 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 
821 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.29 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25.75 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
350 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.68 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.1 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  25.43 
 
 
366 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
818 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  25.75 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.43 
 
 
366 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
375 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
384 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  43.27 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  40.59 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  30.8 
 
 
820 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.97 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.77 
 
 
745 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.69 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 
365 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  31.37 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  45.28 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.62 
 
 
359 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  29.73 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  43.14 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  28.72 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  41.11 
 
 
748 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.17 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>