69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1755 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1755  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
327 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.66004  normal  0.478923 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1614  glycosyl transferase, group 1  53.61 
 
 
330 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2053  glycosyl transferase group 1  55.73 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1726  glycosyl transferase group 1  53.09 
 
 
333 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0614  glycosyltransferase  43.59 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5440  glycosyl transferase group 1  41.05 
 
 
321 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0565  glycosyl transferase group 1  38.06 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2208  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 
317 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0393542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1739  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 
317 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1666  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 
317 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1445  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
321 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  40.91 
 
 
398 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0315  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
419 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0588  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.147569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
389 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
359 aa  49.7  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
360 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
389 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
753 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
386 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
768 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
391 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2245  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
343 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0766  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
400 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.68 
 
 
249 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
400 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.65 
 
 
400 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
341 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  29.22 
 
 
360 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
414 aa  45.8  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.01 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
411 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.43 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.43 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  45.21 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0058  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
413 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
407 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0449  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
394 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
414 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 
364 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  31.9 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
388 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
387 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.68 
 
 
405 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
405 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
413 aa  43.1  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3252  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 
361 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3569  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
460 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.13 
 
 
411 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4279  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 
413 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  36.08 
 
 
417 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 
415 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>