186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0517 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  100 
 
 		 344 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  46.2 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  43.02 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  48.29 
 
 		 357 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  45.77 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  43.84 
 
 		 341 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  45.05 
 
 		 334 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  45.45 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  40.58 
 
 		 347 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  36.97 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  37.24 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  23.99 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  24.48 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2837  aminotransferase class I and II  28.73 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  23.39 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  24.7 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  24.7 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  25.34 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.12 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  26.16 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.98 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  24.12 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.93 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  23.78 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  23.73 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  22.39 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  22.51 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  22.41 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.48 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  22.41 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  21.5 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  26.36 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  22.92 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  25.14 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  18.62 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  27.49 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  23.19 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  26.27 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  22.77 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  23.86 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  27.38 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  20.96 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  24.69 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  20.61 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  24.68 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  25.22 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  20.91 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  25.75 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.87 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  18.24 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  25.63 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.01 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  24.93 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  24.93 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  20.38 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  24.93 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  27.36 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  25.14 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  22.41 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  24.11 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  24.43 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  25.62 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2499  aminotransferase class I and II  26.74 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  24.21 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  23.32 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  22.49 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.07 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  24.64 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  21.69 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  25.14 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  21.47 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  24.36 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  25.48 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  22.99 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  23.62 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  24.84 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  26.92 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  22.83 
 
 		 365 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  22.58 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  24.14 
 
 		 351 aa  52.8  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  23.92 
 
 		 365 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  23.01 
 
 		 365 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  24.63 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.98 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  24.13 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  24.21 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  25.07 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  24.25 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  24.37 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  23.34 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  23.89 
 
 		 365 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  30.17 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  26.45 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  26.94 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>