More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3179 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  100 
 
 
334 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  72.27 
 
 
336 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  62.09 
 
 
357 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  58.43 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  57.58 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  54.2 
 
 
347 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  54.09 
 
 
347 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  54.44 
 
 
353 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  45.05 
 
 
344 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  37.31 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  37.61 
 
 
334 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  24.52 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.61 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  25.75 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.62 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  30.58 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  25.9 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  25.91 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.25 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  29.55 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  24.37 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  22.74 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  26.83 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  29.52 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.74 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.74 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  28.09 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  25.3 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  25.39 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  26.61 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  24.78 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  25.99 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  24.41 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  26.67 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  25.69 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  25.57 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 
359 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  29.14 
 
 
379 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  27.86 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  26.73 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  23.49 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  26.32 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  24.38 
 
 
356 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  25.31 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  25.31 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  25.31 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  24.69 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  21.6 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  25.31 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  22.96 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  26.81 
 
 
852 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  22.86 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  28.7 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
351 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
351 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  26.53 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  24.45 
 
 
355 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  24.93 
 
 
399 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  28.18 
 
 
362 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  23.49 
 
 
371 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  23.19 
 
 
350 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.72 
 
 
379 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  25.9 
 
 
387 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 
365 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  24.21 
 
 
355 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  22.56 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  24.3 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  26.79 
 
 
369 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  23.75 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  28.24 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  25.37 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  25.5 
 
 
386 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  28.24 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  19.7 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  23.77 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  27.6 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  23.99 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  22.67 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0339  histidinol-phosphate aminotransferase  22.22 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0738  aminotransferase, class I and II  23.86 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  21.86 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  25.72 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  21.65 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  21.7 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0362  histidinol-phosphate aminotransferase  22.22 
 
 
364 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  27.22 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  23.62 
 
 
351 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  26.19 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  27.43 
 
 
370 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  22.97 
 
 
370 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  20.41 
 
 
372 aa  59.7  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  20.13 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  23.69 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.89 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  25.32 
 
 
357 aa  59.3  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  22.56 
 
 
350 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>