More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2805 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 347 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  58.43 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  57.31 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  60.54 
 
 		 336 aa  325  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  53.96 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  53.51 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  52.17 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  50.42 
 
 		 353 aa  287  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  36.89 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  40.88 
 
 		 344 aa  175  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  29.11 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  28.49 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.33 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  24.19 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  23.8 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  26.84 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1298  histidinol-phosphate aminotransferase  22.47 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  30.74 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  27.96 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  22.29 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.54 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  25.23 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  26.7 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.51 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  27.96 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  21.97 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  24.93 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  26.3 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  24.18 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.67 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  23.6 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.49 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  21.73 
 
 		 366 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  24.32 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  27.17 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.71 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  21.92 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.69 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  23.37 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.28 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.28 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  27.88 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  20.74 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  25.76 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  20.49 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  25.43 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  27.59 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  26.81 
 
 		 852 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  23.16 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  22.5 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  28.25 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  20.85 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  21.98 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  19.48 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  27.36 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  22.25 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  26.02 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  24.7 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  24.17 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0362  histidinol-phosphate aminotransferase  21.2 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  26.13 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  23.43 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  24.43 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  25.28 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0339  histidinol-phosphate aminotransferase  21.2 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  24.05 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  24.26 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  21.73 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  25.66 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  24.55 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  20.82 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  24.7 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  23.21 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  25.7 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  23.92 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  22.56 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  28.09 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  27.56 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  25.5 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  27.72 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  20.83 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  24.05 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  21.71 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  21.71 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  27.72 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  22.78 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  23.4 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.57 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  19.84 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  18.93 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  27.72 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  26.04 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  22.29 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  18.93 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  27.72 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>