More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2615 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 353 aa  701    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  57.67 
 
 		 347 aa  349  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  55.01 
 
 		 347 aa  335  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  54.09 
 
 		 341 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  54.44 
 
 		 334 aa  295  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  57.18 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  50.42 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  52.53 
 
 		 357 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  46.2 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  38.42 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  24.23 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  24.8 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  29.05 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  28.17 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  27.79 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  31.19 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.57 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.57 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  27.08 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.62 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.8 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  27.37 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  28.61 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  26.39 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.79 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  27.08 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  26.51 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  26.44 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  23.89 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  27.37 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  27.75 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  26.04 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  23.86 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  26.49 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  25.81 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  21.47 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  25.42 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  22.97 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  26.83 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  21.76 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2837  aminotransferase class I and II  27.56 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  24.16 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  22.11 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  24.79 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  22.22 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  25.37 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.38 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  24.38 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  25.28 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  26.01 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  25.5 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  23.65 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  22.02 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  23.47 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  23.6 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.1 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  28.9 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  25.47 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  21.52 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  25.42 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  24.18 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  23.25 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  25.85 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  25.43 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  20.81 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  24.07 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  24.11 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  25.5 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  23.71 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  26.74 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  26.52 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  22.65 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  23.44 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  24.51 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  26.72 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  25.22 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  24.12 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  26.7 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  27.68 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  24.72 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  26.67 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  27.81 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  26.46 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  24.72 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  26.46 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1875  histidinol-phosphate aminotransferase  27.62 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.015293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3819  aminotransferase class I and II  27.21 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0035  putative aminotransferase  27.51 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>