More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2761 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  100 
 
 		 347 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  72.94 
 
 		 347 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  56.89 
 
 		 341 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  55.01 
 
 		 353 aa  335  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  54.2 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  52.17 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  54.08 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  51.82 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  45.77 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  37.43 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  37.28 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.81 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  26.45 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  26.51 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  29.19 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  21.47 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  24.15 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  28.31 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  24.92 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  26.37 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  23.94 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  24.64 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  25.86 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  26.03 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.51 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  25.51 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  26.78 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.2 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  26.37 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.21 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  30 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  24.18 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  26.36 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  24.15 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  25.73 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  24.71 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  25.07 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  23.71 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  24.23 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  26.44 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  25.5 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  24.7 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  25.67 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  25.29 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  23.6 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  25.37 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  24.4 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  24.24 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  24.4 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  26.23 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  23.53 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  23.32 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  24.48 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0971  aminotransferase  26.55 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  23.35 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  22.98 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  26 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  24.28 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  24.12 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  23.64 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  24.92 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  24.23 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  23.12 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  21.8 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  22.51 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  23.8 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  24.17 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  24.12 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25490  aminotransferase  25 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0349529  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  23.56 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  24.2 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  25.78 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  21.75 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  25.67 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  23.12 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  22.83 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  25.6 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  25.86 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0217  aminotransferase, class I and II  25.45 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>