More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2875 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  34.01 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  37.81 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  33.9 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  28.4 
 
 		 383 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  33 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  36.2 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  29.11 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  30.61 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.21 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  26.87 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  26.87 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25 
 
 		 368 aa  99.4  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  25.6 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.33 
 
 		 362 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  30.95 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  31.06 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  28.81 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0367  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  30.9 
 
 		 352 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  29.93 
 
 		 387 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  26.16 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  26.87 
 
 		 331 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  30.58 
 
 		 399 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0772  aminotransferase class I and II  28.52 
 
 		 341 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  28.67 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  25.83 
 
 		 369 aa  89.7  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  27.85 
 
 		 370 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2375  histidinol-phosphate aminotransferase  30 
 
 		 356 aa  89  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.323647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  31.88 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.78 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  26.85 
 
 		 370 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  25.17 
 
 		 380 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.31 
 
 		 496 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  28.33 
 
 		 374 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  24.57 
 
 		 357 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  24.49 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  25.72 
 
 		 370 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  28.86 
 
 		 356 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  26.97 
 
 		 374 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0235  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 		 353 aa  86.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.490059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 347 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.65 
 
 		 375 aa  85.9  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  31.19 
 
 		 353 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.48 
 
 		 358 aa  85.9  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  27.55 
 
 		 357 aa  85.5  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  30.1 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2950  aminotransferase  31.36 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  30.46 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2935  aminotransferase  31.36 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  22.68 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2979  aminotransferase  31.36 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.98 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  27.85 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  28.9 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  24.15 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  27.36 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  26.85 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  29.41 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.11 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  24.5 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  30.42 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  24.92 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.87 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  27.21 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  25.84 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  26.38 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.05 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  25.8 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.4 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  24.91 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  27.55 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  27.27 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  28.38 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  27.72 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3083  histidinol-phosphate aminotransferase  31.84 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  28.72 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  24.73 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  27.81 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  25.48 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  25.91 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1981  histidinol-phosphate aminotransferase  30.09 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  23.05 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  28.25 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  31.14 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  29.49 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  28.33 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  24.6 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  27.84 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.94 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  25.48 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  24.75 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0150  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.646284  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  25.16 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  21.26 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  24.68 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  30.67 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  23.99 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>