More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0964 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 334 aa  672    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  72.95 
 
 		 331 aa  484  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  40.86 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  39.36 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  38.46 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  37.76 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  37.75 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  37.57 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  37.92 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  39.46 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  35.99 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  32.53 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  38.21 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  31.32 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.94 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.23 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  29.55 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  36.52 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33.63 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  31.47 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  29.67 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.96 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.65 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.65 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  29.28 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.8 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  30.47 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.48 
 
 		 370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.49 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.74 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.06 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  30.14 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  30.4 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 		 386 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  31.86 
 
 		 362 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  29.25 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.38 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  29.88 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.36 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.95 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  31.88 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  28.84 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  27.27 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  31.35 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  27.15 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  31.78 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  30.26 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  30.72 
 
 		 386 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  31.49 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  32.85 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1547  histidinol phosphate aminotransferase  27.67 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  28.45 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  28.43 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.47 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  31.78 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  31.49 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  29.13 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  31.78 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  28.03 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.58 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  30.41 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  26.61 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  31.13 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  28.95 
 
 		 863 aa  99.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  28.81 
 
 		 351 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  29.57 
 
 		 371 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1520  histidinol-phosphate aminotransferase  29.22 
 
 		 375 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  30.68 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  30.94 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  31.76 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  31.14 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  29.71 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2015  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.788991  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  30.11 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  29.28 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  27.54 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  26.92 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  30.79 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  25.36 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  29.34 
 
 		 863 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  25.57 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.06 
 
 		 496 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  27.96 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.03 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  31.53 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  29.63 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 364 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.53 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  28.44 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>