More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1546 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  100 
 
 
357 aa  694    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  62.69 
 
 
334 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  59.54 
 
 
336 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  57.39 
 
 
347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  53.65 
 
 
353 aa  299  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  53.07 
 
 
341 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  53.82 
 
 
347 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  52.54 
 
 
347 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  47.83 
 
 
344 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  40.18 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  39.71 
 
 
334 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  30.85 
 
 
357 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.86 
 
 
366 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  28.94 
 
 
354 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  23.93 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  27.79 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  24.61 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.62 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  28.92 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  26.51 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  30.35 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  30.64 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  30.72 
 
 
367 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  26.85 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  26.59 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  27.38 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  26.77 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  26.93 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  27.76 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  30.41 
 
 
852 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  23.12 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  24.05 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  26.25 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  28.62 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  27.25 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  26.14 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.14 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  27.11 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  24.92 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  21.82 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.27 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0268  histidinol-phosphate aminotransferase  21.11 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  25.89 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  24.75 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  27.41 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  28.79 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  25.72 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  25.72 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  24.63 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  24.26 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  28.41 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  26.75 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  25.6 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  27.88 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3739  histidinol-phosphate aminotransferase  27.2 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  0.0735445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  24.77 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  27.11 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  26.54 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  25.72 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  23.78 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  27.66 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  25.44 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  25.62 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  26.32 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 
355 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  26.37 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  25.39 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  25.99 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  26.27 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  24.6 
 
 
373 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  25.24 
 
 
355 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  28.26 
 
 
362 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  23.91 
 
 
331 aa  63.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  28.17 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  27.68 
 
 
371 aa  63.2  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917892 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.11 
 
 
352 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  25.45 
 
 
351 aa  62.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  25.52 
 
 
350 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  29.47 
 
 
286 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  24.16 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  25.5 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  28.93 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  25.57 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2837  aminotransferase class I and II  27.17 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  21.86 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  26.18 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1690  histidinol phosphate aminotransferase  27.76 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.93 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0387  histidinol-phosphate aminotransferase  25.21 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>