More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2147 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 347 aa  695    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  72.94 
 
 		 347 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  60.9 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  57.67 
 
 		 353 aa  349  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  53.51 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  57.96 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  54.09 
 
 		 334 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  52.69 
 
 		 357 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  42.74 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  37.43 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  36.31 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.34 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  27.99 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.21 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  26.91 
 
 		 383 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  27.32 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  22.81 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  24.26 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0141  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  30 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  26.21 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  26.21 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  28.17 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  25.93 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  23.98 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  26.89 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  24.73 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  23.6 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.28 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  23.42 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1120  histidinol-phosphate aminotransferase  26.11 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  26.44 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  22.59 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  23.29 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  23.77 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  23.51 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  23.29 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  24.22 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  27.76 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  23.29 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  26.55 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2470  histidinol-phosphate aminotransferase  26.82 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0316921 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1110  histidinol-phosphate aminotransferase  32.51 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  26.06 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  26.83 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  23.08 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0554  aminotransferase class I and II  24.59 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  25.84 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  22.77 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  25.87 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  25.87 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  26.16 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  25.87 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  25.58 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  22.31 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  25.87 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  25.87 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  28.49 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2101  histidinol-phosphate aminotransferase  28.62 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  24.11 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  23.93 
 
 		 357 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  22.53 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  20.56 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  26.57 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  22.03 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  25.07 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0439  histidinol-phosphate aminotransferase  25.54 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  26.47 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1409  histidinol-phosphate aminotransferase  26.97 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331562  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.08 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  26.14 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  25.52 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  23.31 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  25.69 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  25.73 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  24 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  21.61 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  26.28 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  26.5 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  21.87 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  25.99 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  25 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  23.63 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  26.73 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  23.03 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  26.45 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  24.63 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  23.55 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  25.46 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  23.7 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  25.08 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0665  histidinol-phosphate aminotransferase  27.19 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  27.32 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  24.22 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  24.79 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>