273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2532 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2532  aminotransferase class I and II  100 
 
 
336 aa  655    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3179  aminotransferase  72.59 
 
 
334 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1546  aminotransferase  58.69 
 
 
357 aa  355  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.42012  normal  0.113559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2805  aminotransferase class I and II  60.54 
 
 
347 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.394382  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2556  aminotransferase class I and II  59.94 
 
 
341 aa  345  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256258  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2147  aminotransferase, class I and II  58.56 
 
 
347 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  0.0181386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2615  aminotransferase, class I and II  57.77 
 
 
353 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2761  aminotransferase  54.98 
 
 
347 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.962589  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3402  hypothetical protein  41.72 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.129074  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0517  aminotransferase  44.73 
 
 
344 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.168213  normal  0.0233327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0964  aminotransferase class I and II  40.66 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.701458  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  30.22 
 
 
357 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 
383 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0512  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.749213  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0650  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  31.14 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000240372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1260  aminotransferase class I and II  29.65 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2875  aminotransferase, class I and II  32.76 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.528033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  27.03 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  23.08 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  28.12 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  28.12 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  27.83 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  29.46 
 
 
354 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1344  histidinol-phosphate aminotransferase  28.27 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.453869  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  29.61 
 
 
852 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  26.53 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.06 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2151  aminotransferase class I and II  28.7 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.518477  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  27.51 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0394  histidinol-phosphate aminotransferase  27.55 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567714  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  24.4 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  25.07 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1263  histidinol-phosphate aminotransferase  28.17 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.136203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  26.57 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  22.08 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  28.82 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  26.98 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.75 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  22.08 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  24.26 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  24.16 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.66 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1034  histidinol-phosphate aminotransferase  26.13 
 
 
360 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.843558  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  28.16 
 
 
370 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  26.59 
 
 
863 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  25.3 
 
 
366 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  26.84 
 
 
864 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.57 
 
 
362 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  25.82 
 
 
351 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  26.23 
 
 
373 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  25.52 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  22.82 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  20.86 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  28.7 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1900  histidinol-phosphate aminotransferase  25.55 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  22.56 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  23.72 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  24.48 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  26.85 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  22.3 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0158  putative aminotransferase  28.23 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.26 
 
 
370 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.25 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0607  histidinol-phosphate aminotransferase  24.21 
 
 
399 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  26.42 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1667  histidinol-phosphate aminotransferase  23.23 
 
 
365 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  25.58 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  26.01 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  27.47 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  24.16 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.09 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.78 
 
 
357 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2550  histidinol-phosphate aminotransferase  24.56 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  26.59 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  23.95 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  27.4 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  28.86 
 
 
863 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  29.2 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.57 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  27.1 
 
 
375 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  25.32 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  25.88 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  24.33 
 
 
353 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  20.2 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  19.32 
 
 
358 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  27.48 
 
 
357 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  27.17 
 
 
357 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  20.92 
 
 
373 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  26.38 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0761  histidinol-phosphate aminotransferase  26.14 
 
 
386 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3224  histidinol-phosphate aminotransferase  28.92 
 
 
372 aa  56.2  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0150  aminotransferase class I and II  25.8 
 
 
335 aa  56.2  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.646284  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  21.1 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  28.05 
 
 
357 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  27.76 
 
 
356 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  28.05 
 
 
357 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>