44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2347 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  66.81 
 
 
236 aa  315  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  60.94 
 
 
237 aa  296  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  59.83 
 
 
238 aa  287  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  59.39 
 
 
229 aa  277  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  42.79 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  43.26 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  43.81 
 
 
226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  42.79 
 
 
233 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  44.29 
 
 
227 aa  186  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  43.81 
 
 
227 aa  182  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  43.4 
 
 
230 aa  181  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  43.4 
 
 
230 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  42.92 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  41.98 
 
 
230 aa  178  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  38.46 
 
 
232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  34.7 
 
 
243 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  32.7 
 
 
318 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  30.88 
 
 
248 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  32.44 
 
 
254 aa  109  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  35.1 
 
 
319 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  27.63 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  26.61 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  30.81 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  27.27 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  25.12 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0226  protein of unknown function DUF169  25.99 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0914773  hitchhiker  0.00370988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  26.79 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  27.32 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  25.76 
 
 
261 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  24.67 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  25.84 
 
 
205 aa  58.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3259  hypothetical protein  24.9 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  25.99 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0156  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3745  hypothetical protein  24.45 
 
 
243 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  hitchhiker  0.000000916564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  23.4 
 
 
276 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  24.78 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  24.89 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  22.77 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  26.36 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  23.35 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.618669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  23.38 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  23.37 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>