16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3259 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3259  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3745  hypothetical protein  94.58 
 
 		 243 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  hitchhiker  0.000000916564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  72.43 
 
 		 254 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  26.64 
 
 		 226 aa  62  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  24.9 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  24.45 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  24.8 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  26.52 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  25.66 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  25.22 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  23.43 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  24.34 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  24 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  25.12 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  23.11 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  22.77 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>