42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1923 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  36.65 
 
 
232 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  34.91 
 
 
254 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  31.88 
 
 
256 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  34.7 
 
 
238 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  34.23 
 
 
233 aa  122  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  31.67 
 
 
318 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  33.49 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  30.83 
 
 
319 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  31.36 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  29.49 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  29.68 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  32.57 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  29.22 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  31.19 
 
 
230 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  31.34 
 
 
229 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  30.18 
 
 
237 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  31.63 
 
 
230 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  30.73 
 
 
230 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  28.29 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  27.56 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  29.11 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  26.23 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  29.46 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  26.48 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  25.42 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  25 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  22.22 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.618669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  23.58 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  26.06 
 
 
205 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  23.77 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2193  protein of unknown function DUF169  22.63 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  21.46 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  24.76 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  25.13 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  24.27 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  22.65 
 
 
297 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  22.82 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  24.31 
 
 
261 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  23.58 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  22.71 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>