23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1265 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  66.3 
 
 		 270 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  41.8 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  40.23 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.618669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2193  protein of unknown function DUF169  41.02 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  41.8 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  22.91 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  24.34 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  23.42 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  23.94 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  22.37 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  21.7 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  22.77 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  25.6 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  23.11 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  26.21 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  20.85 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  23.96 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  20.43 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  22.22 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  23.49 
 
 		 261 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>