20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2437 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  100 
 
 
262 aa  551  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.618669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2193  protein of unknown function DUF169  78.52 
 
 
258 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  74.61 
 
 
259 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  68.75 
 
 
297 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  40.23 
 
 
270 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  37.74 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  25.61 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  24.89 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  22.22 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  25.87 
 
 
232 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  29.14 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  25.27 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  22.61 
 
 
319 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  24.02 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  23.35 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  26.06 
 
 
318 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  22.79 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  25.62 
 
 
269 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  24.46 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  22.02 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>