24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2869 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  66.3 
 
 
270 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  39.3 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  39.77 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  37.74 
 
 
262 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.618669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2193  protein of unknown function DUF169  38.91 
 
 
258 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  22.37 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  23.08 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  21.84 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  23.77 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  21.24 
 
 
233 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  22.37 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  19.38 
 
 
232 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  24.68 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  22.17 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  23.38 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  21.9 
 
 
256 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  25.71 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  26.19 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  22.68 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  25.53 
 
 
227 aa  45.8  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  25.45 
 
 
226 aa  45.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  25.71 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  21.66 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>