42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0901 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  494  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  66.1 
 
 
238 aa  330  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  64.76 
 
 
236 aa  321  6e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  60.94 
 
 
238 aa  296  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  58.15 
 
 
229 aa  264  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  45.28 
 
 
229 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  44.34 
 
 
229 aa  202  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  40.28 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  42.22 
 
 
233 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  41.47 
 
 
227 aa  187  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  42.34 
 
 
227 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  41.98 
 
 
230 aa  185  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  40.55 
 
 
230 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  39.17 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  40.09 
 
 
230 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  39.82 
 
 
232 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  34.25 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  34.55 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  30.18 
 
 
243 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  28.32 
 
 
254 aa  95.5  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  28.24 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  25.43 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  27.23 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  25.78 
 
 
272 aa  78.2  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  25.45 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  26.4 
 
 
205 aa  72  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  23.96 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  27.32 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  26.47 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0226  protein of unknown function DUF169  24.55 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0914773  hitchhiker  0.00370988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  26.81 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  25.97 
 
 
263 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  25.66 
 
 
261 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  22.71 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  23.85 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  24.57 
 
 
261 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0156  hypothetical protein  24.78 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  25.81 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  22.17 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  22.57 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  22.22 
 
 
270 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  24.46 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.618669 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>