39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1141 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  544  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  37.25 
 
 
260 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  29.64 
 
 
269 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  28.63 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  29.41 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  28.33 
 
 
236 aa  89.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  27.63 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  26.29 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  27.19 
 
 
229 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  27.06 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  29.39 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  29.82 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  29.82 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  25.43 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  31.65 
 
 
254 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  26.61 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  24.68 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  26.78 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  30.36 
 
 
318 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  29.27 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  28.95 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  27.89 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  28.44 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  26.96 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  27.11 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  28.95 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  25.54 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  25.51 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  25.61 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.618669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  23.58 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  23.18 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  31.37 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  20.98 
 
 
248 aa  55.8  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  27.27 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2193  protein of unknown function DUF169  22.76 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  23.96 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  20.85 
 
 
270 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  22.68 
 
 
270 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  24.73 
 
 
256 aa  45.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>