35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  520  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  33.18 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  34.76 
 
 
232 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  30.88 
 
 
238 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  32.24 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  29.03 
 
 
229 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  28.57 
 
 
229 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  25.73 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  30.23 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  27.23 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  28.24 
 
 
237 aa  95.5  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  25.69 
 
 
238 aa  92  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  23.42 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  29.11 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  22.87 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  21.62 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  24.29 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  26.89 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  23.39 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  25.34 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  26.17 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  23.42 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  23.89 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  21.59 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  24.34 
 
 
270 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  20.98 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  25.12 
 
 
205 aa  55.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  21.84 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  21.52 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  23.71 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  23.47 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  24.32 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  23 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2193  protein of unknown function DUF169  22.9 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>