25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1203 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  49.15 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  31.43 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  29.51 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  31.58 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  31.58 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  24.55 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  25.23 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  26.55 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  26.75 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  26.19 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  30.32 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  28.89 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  26.2 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  25.29 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  30.65 
 
 
319 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  26.47 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  27.32 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  33.73 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  25.4 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  28.34 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  26.7 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  23.71 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  23.83 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  27.43 
 
 
260 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>