40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1034 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  96.52 
 
 
230 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  97.39 
 
 
230 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  83.91 
 
 
230 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  72.12 
 
 
227 aa  343  1e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  61.33 
 
 
227 aa  285  4e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  43.98 
 
 
238 aa  184  9e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  43.06 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  41.7 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  40.55 
 
 
237 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  42.92 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  40.89 
 
 
229 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  40.44 
 
 
229 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  41.4 
 
 
229 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  37.33 
 
 
233 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  34.38 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  34.98 
 
 
319 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  33.03 
 
 
318 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  31.19 
 
 
243 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  28.82 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  29.39 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  29.28 
 
 
250 aa  82  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  29.41 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  22.87 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  28.63 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  29.2 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  24.55 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  23.11 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  28.41 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  26.47 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0226  protein of unknown function DUF169  26.07 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0914773  hitchhiker  0.00370988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  26.64 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0156  hypothetical protein  28.71 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  29.03 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  26.53 
 
 
263 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3259  hypothetical protein  25.22 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3745  hypothetical protein  25.68 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  hitchhiker  0.000000916564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  24.11 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  27.42 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>