43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3467 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  96.51 
 
 
229 aa  454  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  56.64 
 
 
226 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  44.34 
 
 
237 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  43.26 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  45.33 
 
 
238 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  39.63 
 
 
236 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  43.84 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  41.33 
 
 
230 aa  181  7e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  40.44 
 
 
230 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  39.56 
 
 
230 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  39.11 
 
 
230 aa  175  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  40.53 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  35 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  39.21 
 
 
227 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  36.24 
 
 
232 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  37.66 
 
 
319 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  34.65 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  29.68 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  30.57 
 
 
254 aa  102  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  27.63 
 
 
263 aa  88.2  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  30.73 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  27.19 
 
 
260 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  28.04 
 
 
256 aa  85.5  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0226  protein of unknown function DUF169  28.7 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0914773  hitchhiker  0.00370988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  31.58 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  27.85 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  30.51 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  27.32 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  35.23 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0156  hypothetical protein  28.26 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  24.34 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  24.89 
 
 
269 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  23.29 
 
 
261 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  23.11 
 
 
261 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  21.43 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  22.73 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  27.27 
 
 
297 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  26.21 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  26.19 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  23.36 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3745  hypothetical protein  25.79 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  hitchhiker  0.000000916564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>