23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0178 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  28.75 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  27.06 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  27.47 
 
 
226 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  27.43 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  26.64 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  24.34 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  24.15 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  25.38 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  24.9 
 
 
233 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  24.34 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  23.85 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  22.22 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  23.4 
 
 
238 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  24.46 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  24.27 
 
 
243 aa  49.3  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  24.12 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  23.56 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  25 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  23.35 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  21.51 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  20.75 
 
 
230 aa  42.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2259  hypothetical protein  25.37 
 
 
260 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0386104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>