40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0429 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  470  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  59.39 
 
 
238 aa  277  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  55.7 
 
 
236 aa  267  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  58.15 
 
 
237 aa  264  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  58.33 
 
 
238 aa  262  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  41.36 
 
 
226 aa  191  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  43.84 
 
 
229 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  43.84 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  43.12 
 
 
227 aa  185  5e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  44.2 
 
 
233 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  44.09 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  42.38 
 
 
230 aa  170  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  41.86 
 
 
230 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  41.4 
 
 
230 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  40.47 
 
 
230 aa  167  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  40.64 
 
 
227 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  34.39 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  34.35 
 
 
318 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  31.34 
 
 
243 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  30.23 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  30.64 
 
 
272 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  31.43 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  29.63 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  25.75 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  27.11 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  27.07 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  29.44 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  25.99 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0226  protein of unknown function DUF169  29.28 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0914773  hitchhiker  0.00370988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  24.15 
 
 
276 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  27.15 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  22.5 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  23.18 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  25.21 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0156  hypothetical protein  25.68 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  24.84 
 
 
261 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  24.68 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  25.1 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  24.07 
 
 
261 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  24.55 
 
 
254 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>