35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2553 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  559  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  34.69 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  29.64 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  32.64 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  26.59 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  28.75 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  29.11 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  27.66 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  27.97 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  28.69 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  28.02 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  24.29 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  26.89 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  24.57 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  24.89 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  26.05 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  24.89 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  26.47 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  24.45 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  22.5 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  22.57 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  22.71 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  23.5 
 
 		 236 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  24.12 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  24.29 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  26.88 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2193  protein of unknown function DUF169  25.79 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  23 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  23.37 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  25.62 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.618669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  23.14 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0156  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0226  protein of unknown function DUF169  26.61 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0914773  hitchhiker  0.00370988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  24.89 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>