24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0226 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0226  protein of unknown function DUF169  100 
 
 
246 aa  507  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0914773  hitchhiker  0.00370988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0156  hypothetical protein  80.08 
 
 
246 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  27.83 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  28.7 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  28.31 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  26.43 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  29.28 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  25.99 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  26.07 
 
 
318 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  27.31 
 
 
230 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  27.31 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  24.55 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  24.66 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  26.07 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  25.76 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  25.32 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  24.09 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  26.95 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  24.86 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  22.87 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  23.81 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  26.61 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  23.68 
 
 
319 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>