42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0581 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  489  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0901  hypothetical protein  64.76 
 
 
237 aa  321  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0078805  normal  0.30633 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  66.81 
 
 
238 aa  315  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  62.34 
 
 
238 aa  314  8e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0429  hypothetical protein  55.7 
 
 
229 aa  267  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.97921 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  43.52 
 
 
226 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  39.63 
 
 
229 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  39.63 
 
 
229 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  41.2 
 
 
227 aa  187  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  40.44 
 
 
233 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  43.52 
 
 
230 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  43.06 
 
 
230 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  43.06 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0942  hypothetical protein  41.04 
 
 
230 aa  176  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.988388  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0780  hypothetical protein  40.27 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.664572  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0605  hypothetical protein  36.82 
 
 
232 aa  158  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.503532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  31.51 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  31.36 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  31.96 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  29.65 
 
 
254 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  27.23 
 
 
248 aa  95.5  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  28.33 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0861  hypothetical protein  29.11 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  27.31 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0537  protein of unknown function DUF169  25.35 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0226  protein of unknown function DUF169  26.43 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0914773  hitchhiker  0.00370988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4088  hypothetical protein  28.25 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1203  hypothetical protein  25.29 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  27.23 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0924  hypothetical protein  23.31 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3259  hypothetical protein  24.45 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2693  hypothetical protein  23.56 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0392853  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0156  hypothetical protein  25.66 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  23.5 
 
 
269 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0351  protein of unknown function DUF169  25.82 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3745  hypothetical protein  24.41 
 
 
243 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  hitchhiker  0.000000916564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  25 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0178  hypothetical protein  24.46 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0315758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2658  hypothetical protein  23.7 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4610  hypothetical protein  28.06 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  21.49 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3088  protein of unknown function DUF169  24.41 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>