15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3745 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3745  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  502  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  hitchhiker  0.000000916564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3259  hypothetical protein  94.58 
 
 
248 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3125  protein of unknown function DUF169  72.84 
 
 
254 aa  358  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0328  hypothetical protein  28.57 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0220965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  23.43 
 
 
318 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0581  hypothetical protein  24.41 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213239  normal  0.0817202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2347  protein of unknown function DUF169  24.45 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.547457  normal  0.341579 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0504  hypothetical protein  26.52 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.798992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0516  hypothetical protein  25.69 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  23.95 
 
 
319 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3467  hypothetical protein  25.79 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.453769  hitchhiker  0.00174039 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1034  hypothetical protein  26.02 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0910  hypothetical protein  26.53 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0622  hypothetical protein  22.87 
 
 
233 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1771  hypothetical protein  26.02 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>